A APAMO surgiu da necessidade de uma organização que pudesse representar as formas tradicionais da indústria açucareira quando o Governo de Moçambique decidiu revitalizar a indústria. Surgiu quando o açúcar estava a tornar-se cada vez mais importante em várias indústrias e lares.

Em 2001, a criação da Associação dos Produtores de Açúcar de Moçambique desempenhou um papel fundamental na formação da economia do país. Um consórcio de produtores de açúcar e veteranos da indústria em Moçambique formaram uma organização com uma visão estratégica para o futuro da indústria do açúcar. O seu objetivo é definir o sector e promover um crescimento sustentável no país.